Pierre Baduel
équipe PÉpiTE
Polyploïdie et Épigénétique des Éléments Transposables
(ouverture en Septembre 2024 !)
Contexte
Comprendre les mécanismes moléculaires responsables de la transmission des variations phénotypiques au travers des générations reste un défi majeur en biologie évolutive, notamment pour comprendre l’adaptation des organismes face aux changements environnementaux brutaux. Dans ce cadre, notre équipe s’intéresse aux mécanismes génétiques et épigénétiques par lesquels les éléments transposables contribuent à la génération de variation phénotypique héritable et l’influence que la polyploïdie peut avoir sur ces mécanismes. Pour cela, nous utilisons la plante Arabidopsis thaliana comme modèle expérimental car les outils de manipulation du génome, de l’épigénome, et de la ploïdie qui y sont disponibles en font un système unique pour étudier ces questions.
Étant donné la prévalence de la polyploïdie chez les plantes, notamment domestiquées ou invasives, et l’importance des TEs comme générateurs de variations phénotypiques héritables, par leurs capacités mutagènes et épimutagènes, nous espérons apporter avec nos travaux une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires qui contribuent à l’adaptation, et à plus long terme l’évolution, des espèces.
Baduel P, Sammarco I, Barrett R, Coronado-Zamora M, Crespel A, Díez-Rodríguez B, Fox J, Galanti D, González J, Jueterbock A, Wootton E, Harney E. The evolutionary consequences of interactions between the epigenome, the genome, and the environment. Evolutionary Applications (2024)
Baduel P and Sasaki E. The genetic basis of epigenetic variation and its consequences for adaptation. Current Opinion in Plant Biology (2023)
Sasaki T, Ro K, Caillieux E, Manabe R, Bohl-Viallefond G, Baduel P, Colot V, Kakutani T, Quadrana L. Fast co-evolution of anti-silencing systems shapes the invasiveness of Mu-like DNA transposons in eudicots. The EMBO Journal (2022)
Baduel P, Quadrana L. Jumpstarting evolution : How transposition can facilitate adaptation to rapid environmental changes. Current Opinion in Plant Biology (2021)
Baduel P, Leduque B, Ignace A, Gy I, Gil J, Loudet O, Colot V, Quadrana L. Genetic and environmental modulation of transposition shapes the evolutionary potential of Arabidopsis thaliana . Genome Biology (2021)
Baduel P, Colot V. The epiallelic potential of transposable elements and its evolutionary significance in plants. Philosophical Transactions of the Royal Society B (2021)
Baduel P, Quadrana L, Hunter B, Bomblies K, Colot V. Relaxed purifying selection in autopolyploids drives transposable element over-accumulation which provides variants for local adaptation. Nature Communications, (2019)
Monnahan P*, Kolář F*, Baduel P*, Sailer C, Koch J, Horvath R, Laenen B, Schmickl R, Paajanen P, Fuxová G, Holcová M, Arnold B, Weismann C, Marhold K, Slotte T, Bomblies K, Yant L Pervasive population genomic consequences of genome duplication in A. arenosa . Nature Ecology & Evolution. (2019) *authors contributed equally
